Nacionālais dabas un zinātnes muzejs atrodas
Ueno parka austrumu galā. Tas tika atvērts 1871. gadā. Tā sastāv no divām ēkām – Globālās galerijas un Japānas galerijas. Globālā galerija apmeklētājiem stāsta par dzīvības evolūciju uz mūsu planētas, kā arī zinātnes un tehnoloģiju attīstību. Japāņu galerija stāsta par Japānas arhipelāga dzīves vēsturi un attīstību.